Công ty Yamaha Motor Việt Nam chính thức được thành lập vào ngày 24/01/1998, nhưng phải đợi đến ngày 02/10/1998, nhà máy đầu tiên tại Sóc Sơn, Hà Nội mới chính thức được khởi công xây dựng.
Ngày 07/10/1999 là cột mốc đáng nhớ đánh dấu chiếc xe máy đầu tiên của Yamaha được ra mắt tại Việt Nam với tên gọi Sirius cùng khẩu hiệu đầy tự tin và thách thức “Are You Stylish” thế hiện chất lượng bền bỉ và thiết kế đột phá.
Đến năm 2002, Yamaha giới thiệu Nouvo tại Việt Nam và nó trở thành mẫu xe tiên phong trong phân khúc xe ga thể thao. Nouvo nhanh chóng đưa Yamaha chiếm lĩnh thị phần của phân khúc này với ưu điểm về thiết kế đẹp, động cơ bốc và dần trở thành một trong những dòng xe bán chạy nhất trong hơn một thập kỷ qua tại Việt Nam.
Sau 5 năm hình thành và phát triển, đến năm 2003 Yamaha Motor Việt Nam đã đạt được cột mốc quan trọng với 100.000 xe bán ra thị trường. Hai năm sau đó (tháng 1/2005), Yamaha chính thức khánh thành nhà máy sản xuất phụ tùng xe máy tại Hà Nội.
Tháng 2/2006 đánh dấu sự xuất hiện của Yamaha Exciter với động cơ 135cc mạnh mẽ cùng kiểu dáng ấn tượng, nó nhanh chóng trở thành biểu tượng của dòng xe số thể thao cao cấp và cho đến nay vẫn là một trong những dòng xe thành công và nổi tiếng nhất của Yamaha tại Việt Nam, được mệnh danh là “Ông Vua Đường Phố”.
Năm 2008, nhà máy thứ 2 của Yamaha Motor Việt Nam chính thức đi vào hoạt động, hướng đến mục tiêu bản được 1 triệu xe máy/năm, cùng năm đó hệ thống đại lý Yamaha 3S cũng chính thức cán mốc 300 cửa hàng trên toàn quốc. Tháng 9/2011, mẫu xe tay ga dành cho phái nữ Nozza được ra mắt với hình ảnh “For the beauty of Viet Nam”, đánh dấu hướng đi mới của Yamaha khi mở rộng thị trường ra phân khúc xe tay ga thời trang.
Bên cạnh việc sản xuất, Yamaha Motor Việt Nam cũng rất tích cực tham gia và tổ chức những hoạt động cộng đồng bổ ích, đặc biệt là dành cho giới trẻ, cùng với nhiều đóng góp thiết thực cho sự phát triển bền vững của xã hội thông qua các chương trình như “Yamaha Kid Donation”, “YSRS Hướng Dẫn Lái Xe An Toàn”, “giải đua xe chuyên nghiệp Yamaha GP”…